我們的能量從哪裏來?為什麼會有兩種性彆?我們為何會成長、死亡?
地球上繽紛多采的生命背後,究竟有著什麼樣的祕密?
這所有問題的解答,都是——粒綫體。
本書作者尼剋.連恩是榮獲英國皇傢學會科學圖書大奬的生化學傢,在《生命的躍升》中,他從宏觀的角度來看生命的起源和演化;而在這本《能量、性、死亡》中,他以一個非常微觀的角度(十億個粒綫體隻有一粒沙那麼大),來迴答生物學的重大問題——也就是我們的生、老、病、死。
粒綫體雖然微小,卻是生物不可或缺的重要胞器。我們每個人的體內都帶有一萬兆個粒綫體,約占體重的百分之十。這個微小的胞器曾經是自由生活的細菌,卻在二十億年前被吞噬進更大的細胞中,從此和宿主細胞共同生活在一起,形塑瞭生命的紋理。粒綫體對生物的重要性,可以用以下幾個例子來說明:
.生物的發電廠:粒綫體會利用氧氣將食物徹底燃燒,産生我們生存所需的所有能量。
.粒綫體夏娃:粒綫體的基因隻會透過母親遺傳給子代,因此一直追溯粒綫體的基因,我們就能找到現存人類的母係最近共同祖先,也就是十七萬年前在非洲的「粒綫體夏娃」。
.犯罪鑑定:不管是活人還是死屍,都可以利用粒綫體基因來進行親緣鑑定。俄羅斯末代沙皇尼古拉二世失散的女兒安娜公主,還有九一一事件的遺體,都是藉由粒綫體基因來鑑定身分。
.老化理論:粒綫體運作時會滲漏齣「自由基」,研究指齣,自由基會攻擊細胞內的基因,而這也是造成我們老化和退化性疾病的原因。
.細胞凋亡:人體內老化的細胞會進行所謂的「細胞凋亡」,這是細胞為瞭個體的整體利益,犧牲小我完成大我的自殺行為。如果細胞在該凋亡時不凋亡,可能就會演變成癌細胞。而這個重要的自殺機製,正是由粒綫體所掌握的。
透過這個微小的東西,我們可以窺視生命完整的麵貌,瞭解生命的本質。就像尼剋.連恩在本書結尾所說的:
人類總是仰望星空,想著我們的世界為何生意盎然,充滿植物和動物?我們來自哪裏?等在前方的命運是什麼?生命、宇宙以及萬事萬物的終極解答,是那樣的神祕而簡短:答案是粒綫體。因為粒綫體告訴瞭我們:在這個星球上,分子如何迸發齣生命,細菌又為何會長久稱霸地球;第一個復雜細胞如何誕生,溫血動物為什麼會崛起;為什麼我們有性行為、有兩種性彆、有孩子,還會戀愛。它還告訴我們,為什麼我們的時日有限,終究會老會死,而我們該怎麼做纔能避免老化的苦難。就算它沒有指引我們生命的意義,也至少,可以稍微解釋生命為什麼是這般模樣。畢竟,如果連生命都解釋不通,那這世界上還有什麼是有意義的呢?
得奬紀錄
◎ 英國皇傢學會科學圖書大奬決選入圍
◎ 《經濟學人》年度好書
◎ 《泰晤士高等教育報》年度年輕科學作傢
作者簡介
尼剋.連恩 Nick Lane
連恩是演化生化學傢,也是英國倫敦大學學院的榮譽教授(Honorary Reader)。他的研究主題為演化生化學及生物能量學,聚焦於生命的起源與復雜細胞的演化。除此之外,他也是倫敦大學學院粒綫體研究學會的創始成員,並領導生命起源的研究計畫。連恩齣版過三本叫好又叫座的科普書,至今已被翻譯為二十國語言。二○一○年,他以《生命的躍升》(Life Ascending)獲得科普書最高榮譽--英國皇傢學會科學圖書大奬;本書則入圍上述大奬的決選名單,以及《泰晤士高等教育報》年度年輕科學作傢的候選名單,同時也被《經濟學人》提名為年度好書。連恩博士現居倫敦,關於更多他的資訊,請造訪他的個人網站:www.nick-lane.net
譯者簡介
林彥綸
颱大植物係倒數第二屆畢業生。現居美國水牛城攻讀生物學博士,將英文譯成中文時會覺得離傢鄉比較近。
緻謝
引言 粒綫體:生命世界的地下統治者
第一部 有前途的怪物:真核細胞的起源
1. 演化大斷層
2. 追尋祖先
3. 氫假說
第二部 左右生命的力量:質子動力與生命起源
4. 呼吸作用的意義
5. 質子動力
6. 生命起源
第三部 內綫交易:建立復雜性
7. 細菌為何如此單純
8. 為何粒綫體能實現復雜性
第四部 冪次定律:尺寸與通達復雜性的斜坡
9. 生物學的冪次定律
10. 溫血革命
第五部 他殺還是自殺:動亂之中個體誕生
11. 體內的衝突
12. 建立個體
第六部 性彆戰爭:史前人類與性彆的本質
13. 性彆不平等
14. 來自史前人類考古的性彆啓示
15. 為什麼會有兩種性彆
第七部 生命之鍾:為何最後粒綫體會殺死我們
16. 粒綫體老化理論
17. 自動校正機的死亡
18. 治療老化?
結語
詞匯錶
延伸閱讀
中英對照錶
深度導讀
粒綫體在生命中的重要角色
尼剋.連恩是英國著名的演化生化學者及享有盛名的科普作傢,他曾於二○一○年以《生命的躍升》獲得英國皇傢學會科學圖書大奬,是最具影響力的一位當代科普作傢。這本《能量、性、死亡:粒綫體與我們的生命》是他在二○○五年的另一本饒富趣味、充滿科學探索與創新思維的钜著。他博覽過去將近一個世紀以來與粒綫體相關的研究論文,以嚴謹的態度加上犀利的文筆,寫瞭這一本非常有曆史觀和可讀性的科普專書。譯者的文筆非常平實、簡潔和洗鍊,對科學名詞的翻譯掌握自如,能夠忠於原作者的寫作風格,又真實傳達瞭書中的科學知識,以及作者對各個議題的洞見,非常難得,實在是一本值得一看再看的好書。
本書首先介紹粒綫體的許多重要生物功能,並且思考粒綫體賦予生命的意義。尼剋.連恩從他最擅長的演化生物學觀點切入,探索粒綫體在真核細胞生物及高等多細胞動物演化過程中的重要角色。他從古細菌的發現及其基因轉錄機製與真核細胞類似,來討論真核生物的演化;接著他闡述沒有粒綫體的古原蟲在大約二十億年前,就因為沒有吞進會進行呼吸作用的古細菌,而和真核生物分開演化瞭。他也提齣粒綫體擁有它自己的基因體所代錶的生物意義,並因為能夠進行呼吸作用提高生産能量的效率,而賦予高等生物結構復雜性。高等生物細胞中的粒綫體並非單獨運作,而是以網絡結構有效地傳送能量貨幣ATP到需要能量的部位,這也讓多細胞生物得以逐漸演化齣龐大而多元化的體型。
接著,尼剋.連恩說明粒綫體為何被稱為細胞的發電廠,闡述此一具有內膜與外膜的雙膜胞器如何在真核細胞中製造ATP:它運用內膜上的呼吸鏈傳遞來自 NADH 或 FADH2 的電子和質子,在此一過程中産生質子動力(proton motive force),以驅動 FoF1 ATPase 閤成ATP。他也利用此一主題深入淺齣地介紹瞭彼得.米歇爾(Peter Mitchell)贏得一九七八年諾貝爾化學奬的化學滲透理論(chemiosmotic theory)。然而,粒綫體在傳遞電子的過程中會産生電子滲漏(electron leak),不但降低製造ATP的效率,也引發活性氧分子(reactive oxygen species)和自由基的産生,為生物體內氧化壓力(oxidative stress)與氧化性傷害的主要來源,也會導緻人類退化性疾病及老年相關的疾病。本書也提及哺乳動物的基礎代謝速率與體重的相關研究,其實這也跟動物壽命的長短有密切關係,其中的分子機製牽涉細胞中粒綫體産生活性氧分子的速率。壽命較長的動物體內,粒綫體産生的活性氧分子往往較壽命短的物種來得低,而活性氧分子與動物壽命長短之間的因果關係,已在飲食限製的研究中得到實證。然而,尼剋.連恩對於哈曼(Denham Harman)在一九七二年提齣的自由基老化理論非常不以為然,提齣許多反駁的證據,也嚴厲批評食用抗氧化劑可以防止老化的說法。
本書也從演化的觀點探討粒綫體基因為什麼仍然存在真核生物細胞中。粒綫體是除瞭細胞核之外唯一擁有遺傳物質(粒綫體DNA)的胞器,動物和人體內的不同細胞可以含有數百至數韆個不等的粒綫體,每一個粒綫體通常有二至十個拷貝數的粒綫體DNA,而且還可以進行DNA復製、基因轉錄及蛋白質閤成,但是這些基因錶現受到細胞核的控製—粒綫體DNA復製、轉錄和轉譯等生化反應所需之各種酵素、蛋白質及調節因子,皆為細胞核中的基因所製造。因此,核DNA和粒綫體DNA上許多基因的協閤錶現,對於閤成正常功能的粒綫體非常重要。因此,正常的細胞功能必須仰賴粒綫體和細胞核之間密切的對話。由於粒綫體DNA是缺乏組蛋白(histone)保護的裸露DNA分子,而且又暴露在不斷産生氧自由基的環境下,非常容易遭受氧化性破壞,再加上粒綫體修補DNA損傷的功能不夠完備。因此,人體和哺乳動物細胞的粒綫體DNA突變速率,大約是核DNA的數十倍之多,此等粒綫體DNA特性是其功能隨年齡增加而逐漸衰退的原因之一。而且,由於粒綫體DNA序列變異速率高,粒綫體DNA定序已被考古學傢用於追溯人類起源和演化關係的研究。美國加州柏剋萊大學威爾遜教授的研究團隊,就是利用粒綫體DNA序列變異分析,於一九八七年在《自然》期刊發錶一篇經典論文,指齣現代人類的祖先是一名非洲婦女(粒綫體夏娃)。此外,粒綫體DNA定序也被廣泛應用於親緣鑑定和犯罪現場生物跡證的科學鑑定。
尼剋.連恩認為粒綫體相關研究一直不太能引起科學研究者的興趣,一方麵是因為生物能量學牽涉的嚮量生化學和熱力學很艱深難懂,而且近三十年來分子生物學的研究都著重在細胞核內基因的活動及調控。長期從事粒綫體DNA研究的華勒斯(Douglas Wallace),深信粒綫體DNA不應該被分子遺傳學研究者忽略,他和少數幾位研究粒綫體疾病的醫師科學傢曆經多年努力,終於在一九八八年底首度證實,粒綫體DNA突變與一些人類疾病(例如萊氏遺傳性視神經病變)的緻病有極為密切的關係,這纔引起醫界和學術界對粒綫體疾病的分子機製和遺傳學研究的重視。很重要的另一轉摺是在九○年代中期,生物學傢發現粒綫體在細胞凋亡的過程扮演仲裁者和執行者的重要角色,這纔瞭解粒綫體不隻掌管細胞的生存,也決定細胞的死亡。因此,《科學》期刊在一九九九年以封麵故事邀請剛入選美國國傢科學院院士的華勒斯寫一篇專文,介紹粒綫體DNA突變和人類疾病與粒綫體疾病動物模式的研究(Science 283:1482-1488)。
尼剋.連恩更深一層探索細胞凋亡在演化上的意義,他從演化的觀點闡釋細胞凋亡對於生物個體間互相競爭和族群永續生存的重要性,凋亡在生物發育和維持個體之生理恆定有其積極的作用。研究人員透過顯微鏡觀察綫蟲體內一韆零九十個體細胞,發現在不同發育時期須分批進行細胞凋亡纔能變為成蟲。動物或人體在發育過程中,若不能正常進行凋亡以清除不需要或遭破壞的細胞,會導緻畸型、癌癥、退化性疾病和免疫缺陷等疾病。有一些抗癌藥物甚至是誘發癌細胞的凋亡而達到治療的目的。此後就帶動瞭一波非常活躍的粒綫體醫學研究,確定凋亡是由一些粒綫體內的蛋白質(例如細胞色素c)或酵素催化,而進行之程式性自殺死亡,其中扮演劊子手的酵素,都在其結構之特定區位帶有半胱胺酸(cysteine)。本書還特彆指齣,從粒綫體釋放齣來帶動細胞凋亡的所有蛋白質(包括細胞色素c),都是來自遠古時代的有氧共生細菌,尼剋.連恩認為大部分的凋亡蛋白是因為粒綫體的祖先被併吞而帶進真核生物,這也說明瞭凋亡是演化過程中被保留下來的重要生物功能。
本書也從演化生物學者的角度,對粒綫體DNA的母係遺傳提齣討論,作者看待這種獨特的單親遺傳的想法很發人深省,他認為卵細胞體積大,可以儲存最大量的粒綫體,而且為瞭在細胞分裂過程讓細胞核與粒綫體DNA的配對穩定,保障具有正確核?酸序列之粒綫體DNA能代代相傳,卵細胞會運用「粒綫體瓶頸」這個特彆的機製淨化,篩選齣完整無瑕的粒綫體,對於成功受孕及受精卵的正常發育有極為重要的貢獻。也正由於粒綫體DNA是母係遺傳,有一些神經肌肉疾病是粒綫體DNA突變所導緻的疾病,最近過去二十餘年的研究,已發現超過一百種粒綫體DNA突變造成的人類疾病,譬如萊氏遺傳性視神經病變就是母係遺傳的疾病,而且大約七成的病人是男性。
另一個重要的議題是:如何保證隻有雌性生物的粒綫體被遺傳下來?科學研究已證實雄性動物的粒綫體及其DNA,在精卵受精後會被徹底排除在受精卵之外,即使闖入卵子,雄性粒綫體也會被泛素化修飾(ubiquitination),終究難逃被分解的命運;而不同種類之雌性動物還有其他遺棄粒綫體及其DNA的方式。本書也提到,有一些不孕癥女性是因為她們的卵子細胞有粒綫體缺陷(或含有粒綫體DNA突變)。若將年輕健康女性卵細胞中的正常粒綫體轉移到不孕癥女性的卵細胞(此技術稱為卵質轉移),就可以受精發育,這種兩女一男閤作生育嬰兒的技術,似乎可以解決一部分不孕癥夫妻的問題,但是在醫學倫理上仍有其爭議,在美國及許多先進國傢是被法律所禁止的醫療行為。
作者最後闡述粒綫體在電子傳遞鏈滲漏的電子或氧自由基,可以造成人體細胞的氧化損傷,會導緻退化性疾病或其他疾病。他也對提倡多年的粒綫體老化理論提齣自己的看法。他雖然接受粒綫體DNA隨著年齡增加而逐漸發生變異或突變,但似乎不同意將老化完全歸因於粒綫體DNA遭受氧化損傷及其經年纍月的纍積。我個人認為粒綫體和細胞核的雙嚮調控失常,以及兩個基因體的DNA變異和基因錶現異常,都和老化過程的身體機能衰退有關。本書最後列瞭許多「延伸閱讀」的一般書目及代錶性的研究論文,建議有興趣深入瞭解特定主題的讀者,可以找來深入研讀,不但可增加對於該討論主題的瞭解,也可獲得學習的快樂和獨到的心得。
魏耀揮
魏耀揮 陽明大學生化暨分子生物研究所教授及馬偕醫學院校長,從事老化與粒綫體疾病研究。二○○二年與日韓二十餘位教授、醫師創立亞洲粒綫體研究醫學會,並於二○○五至二○○八年間擔任理事長。二○○六年與國內學者和醫師成立颱灣粒綫體研究醫學會,緻力推動粒綫體醫學及相關研究。
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